Rozpoczęte w latach 90 XX w. przez dra inż. Krzysztofa Mikołajczyka, wraz z zespołem, prace nad oprogramowaniem do ilościowej analizy danych z pozytonowej tomografii emisyjnej doprowadziły do powstania w 2003 roku PMOD Technologies Ltd. Firma obecnie dominuje światowy rynek narzędzi do analizy ilościowej wyników pomiarów z użyciem PET na potrzeby badań przedklinicznych leków. Oprogramowanie wykorzystywane jest przez środowisko naukowe, firmy farmaceutyczne oraz kontraktowe ośrodki badawcze (CRO). W latach 2017-2021 cytowane było w ponad 2000 publikacji naukowych. O znaczeniu firmy na rynku świadczy przejęcie jej w 2019 roku przez Bruker Corporation.
Dyscyplina, której dotyczy opis wpływu
Inżynieria biomedyczna
Informacja, czy opis wpływu został zgłoszony jako:
[5a] wymagany w związku z liczbą N, przy czym należy wskazać kolejność uwzględniania opisów wpływu w ewaluacji jakości działalności naukowej***
Tak – 1
[5b] dodatkowy, w związku z prowadzeniem działalności naukowej w ramach dyscypliny naukowej należącej do dziedziny nauk humanistycznych, dziedziny nauk społecznych albo dziedziny nauk teologicznych, związany z wybitnymi monografiami naukowymi, słownikami biograficznymi, słownikami bibliograficznymi lub bazami danych, szczególnie istotnymi dla rozwoju danej dziedziny nauki, przy czym należy wskazać kolejność uwzględniania w ewaluacji jakości działalności naukowej
nie
[5c] dodatkowy, w związku z prowadzeniem działalności naukowej w ramach dziedziny nauk inżynieryjno-technicznych, związany z projektami architektonicznymi, urbanistycznymi lub planami zagospodarowania przestrzennego, przy czym należy wskazać kolejność uwzględniania w ewaluacji jakości działalności naukowej
nie
[5d] dodatkowy, w związku z utworzeniem innego podmiotu w celu komercjalizacji wyników badań naukowych lub prac rozwojowych lub know-how związanego z tymi wynikami, zwanej dalej „komercjalizacją”, związany z działalnością utworzonego podmiotu, wraz z podaniem nazwy tego podmiotu, przy czym należy wskazać kolejność uwzględniania w ewaluacji jakości działalności naukowej*****
nie
Informacja o efektach działalności naukowej mających znaczenie dla kreowania wpływu, w tym*:
[6a] charakterystyka głównych wniosków z badań naukowych lub prac rozwojowych (maksymalnie 2500 znaków ze spacjami dla każdej wersji językowej)
U podstaw działalności firmy PMOD leżą prace nad jednym z pierwszych na świecie zastosowań języka JAVA do budowy złożonych, rozległych systemów przetwarzania obrazowych danych medycznych. Twórcy dokonali m.in. nowatorskiej implementacji algorytmów dopasowania modeli matematycznych do danych pomiarowych pochodzących z emisyjnej tomografii pozytonowej umożliwiając modelowanie kinetyki znaczników izotopowych w diagnozowanych tkankach i narządach, co jest fundamentem ilościowej analizy wyników badań PET, w której specjalizuje się firma (publikacja 1, pkt 6c). W pierwszych pracach autorzy dokonali implementacji zaawansowanych algorytmów przetwarzania obrazowych danych medycznych uzyskanych zarówno metodami tomografii PET i SPECT jak i MR oraz CT (publikacja 1, pkt 6c). W tym okresie powstałą również, kluczowa dla tej działalności platformowo niezależna implementacja standardu DICOM zrealizowana w języku JAVA (publikacja 2, pkt 6c).
Późniejsze prace badawcze pozwoliły na wprowadzenie dodatkowych, nowych możliwości opracowanych narzędzi informatycznych. Jedną z nich było nowatorskie użycie metod analizy klastrów do wyszukiwania korelacji pomiędzy parametrami ilościowymi uzyskiwanymi, opracowanymi wcześniej metodami, z danych PET a ekspresją genową tkanek nowotworowych (publikacja 3, pkt 6c).
Kolejną pracą, której wyniki zostały zaimplementowane w oprogramowaniu firmy PMOD jest automatyczna metoda segmentacji komory serca, będąca niezbędnym narzędziem używanym na wstępnym etapie przetwarzania ilościowego danych kardiologicznych PET mającego na celu wyznaczania perfuzji i parametrów hemodynamicznych mięśnia sercowego (prace 4 i 5, pkt 6c).
[6b] charakterystyka roli podmiotu w osiągnięciu efektów działalności naukowej (maksymalnie 1000 znaków ze spacjami dla każdej wersji językowej)
Prace nad oprogramowaniem do ilościowej analizy danych z Emisyjnej Tomografii Pozytonowej (PET) rozpoczęto w latach 1996–1998. Prace prowadzone były przez zespół z Instytutu Inżynierii Precyzyjnej i Biomedycznej Politechniki Warszawskiej we współpracy z Uniwersytetem w Zurychu i Szpitalem Uniwersyteckim w Zurychu. Trzonem zespołu zaangażowanego w prace nad oprogramowaniem PMOD ze strony Politechniki Warszawskiej byli dr inż. Krzysztof Mikołajczyk (pracownik 1993-2019), mgr inż. Michał Grodzki i mgr inż. Piotr Rudnicki (doktoranci 1996-2001). Współautorem ze strony szwajcarskiej był dr Cyrill Burger.
W latach 1996-2002 zespół wykonywał prace badawcze finansowane ze środków Politechniki i Komitetu Badań Naukowych, których celem było opracowanie procedur używanych do testowania i weryfikacji algorytmów oprogramowania PMOD.
Do 2003 roku PW była współwłaścicielem praw do oprogramowania. W 2003 prawa majątkowe przeniesione zostały na nowo utworzoną spółkę PMOD Technologies LLC.
[6c] opis bibliograficzny i streszczenie nie więcej niż 5 osiągnięć naukowych, o których mowa w §2 ust.10 pkt 4–6 (artykułów naukowych; monografii naukowych, rozdziałów w monografiach naukowych – autorstwo i redakcja), będących rezultatem badań naukowych lub prac rozwojowych, prowadzonych w okresie objętym ewaluacją jakości działalności naukowej albo przed tym okresem, ale zakończonych nie wcześniej niż w dwudziestym roku poprzedzającym pierwszy rok objęty ewaluacją jakości działalności naukowej (od 01.01.1997), jeżeli dowody tej działalności powstały w okresie objętym ewaluacją (01.01.2017-31.12.2021), ze wskazaniem głównych autorów tych osiągnięć, którzy są lub byli zatrudnieni w podmiocie albo odbywali kształcenie w podmiocie
(maksymalnie 500 znaków ze spacjami na każde osiągnięcie dla każdej wersji językowej);
UWAGA: Opis bibliograficzny i streszczenie osiągnięcia naukowego mogą uwzględniać adres strony internetowej, pod którym w dniu umieszczenia opisu wpływu w Systemie POL-on jest dostępne dane osiągnięcie.
Publikacje zespołu, podkreśleni pracownicy PW.
Charakterystyka wpływu działalności naukowej, w tym której wyniki są przedmiotem komercjalizacji, ze wskazaniem związku między działalnością naukową a tym wpływem oraz grupy społecznej będącej beneficjentem tego wpływu i obszaru, na który działalność naukowa ma największy wpływ
Prace nad oprogramowaniem do ilościowej analizy danych PET realizowane były od 1996 roku, wspólnie przez zespół z Instytutu Inżynierii Precyzyjnej i Biomedycznej Politechniki Warszawskiej we współpracy z Uniwersytetem w Zurychu i Szpitalem Uniwersyteckim w Zurychu, dzięki finansowaniu z Swiss National Science Foundation (SNSF) w ramach projektu 7PLPJ048289: Development of Methods and a Software Environment for Quantitative Analysis of Positron Emission Tomography Data.
Uzupełniające prace badawcze finansowane w latach 1996-2002 ze środków Politechniki Warszawskiej i Komitetu Badań Naukowych skupiały się na narzędziach do weryfikacji działania algorytmów zaimplementowanych w oprogramowaniu PMOD.
W kolejnych latach bliska współpraca kadry PMOD Technologies z Instytutem Metrologii i Inżynierii Biomedycznej owocowała obopólnymi korzyściami w postaci przepływu know-how i umiejętności. Jednym z efektów tego przepływu była implementacja w oprogramowaniu PMOD opracowanej przez dra inż. Tomasza Kubika, w ramach pracy doktorskiej (obrona w 2018 roku), nowej metody segmentacji mięśnia sercowego w obrazowych danych medycznych (patrz [6], pkt 4 i 5).
Obecnie firma PMOD Technologies LLC dostarcza kompleksowe rozwiązania informatyczne przeznaczone do przetwarzania danych obrazowych w badaniach obrazowania molekularnego. Oferuje zestawy dedykowanych narzędzi, które od lat sprawdzają się w wiodących ośrodkach badawczych, na całym świecie. Oferta PMOD bazuje na ponad 20-letnim doświadczeniu twórców w technice ilościowej tomografii pozytronowej (PET), co zaowocowało wykorzystaniem oferowanego oprogramowania w ponad 2000 oryginalnych prac badawczych w latach 2017-2021 (patrz [8] pkt 1).
Klientami i beneficjentami oferowanych przez firmę rozwiązań jest społeczność badawcza zajmująca się wykorzystaniem techniki PET, zarówno w środowisku akademickim, jak i przemysłowym. Kluczowymi odbiorcami oprogramowania są koncerny farmaceutyczne oraz wykonujące na ich zlecenie badania przedkliniczne tzw. kontraktowe organizacje badawcze (Contract Research Organization – CRO). Firma posiada obecnie ponad 500 użytkowników na całym świecie (> 1000 indywidualnych licencji) (patrz [8] pkt 2).
Firma PMOD jest wiodącym producentem oprogramowania do ilościowej analizy danych z tomografii PET wykorzystywanym podczas badań naukowych, w tym podczas badań przedklinicznych nowych leków (patrz [8] pkt 3 i 4). O jej znaczeniu na tym rynku świadczy przejęcie firmy przez korporację Bruker w 2019 roku (patrz [8] pkt 3). Szczegóły finansowe transakcji nie zostały ujawnione.
Szczegółowa charakterystyka nie więcej niż 5 dowodów wpływu działalności naukowej
(maksymalnie 500 znaków ze spacjami na każdy dowód dla każdej wersji językowej), a w przypadku opisu, o którym mowa w pkt 5d, nie więcej niż 5 dowodów wpływu będących wynikiem działalności naukowej innego podmiotu utworzonego przez podmiot w celu komercjalizacji
UWAGA: Charakterystyka może uwzględniać adres strony internetowej, pod którym w dniu umieszczenia opisu wpływu w Systemie POL-on jest dostępny dany dowód wpływu).
Informacja, czy wpływ powstał w wyniku interdyscyplinarnych badań naukowych lub prac rozwojowych, oraz charakterystyka znaczenia interdyscyplinarności badań naukowych lub prac rozwojowych dla powstania tego wpływu
U podstaw sukcesu firmy PMOD leży zastosowanie wyprzedzających swoje czasy rozwiązań informatycznych w zakresie implementacji zaawansowanych algorytmów przetwarzania danych, co jest domeną dyscypliny Informatyka (praca 1, pkt 6c) oraz nowej implementacji standardu DICOM – Informatyka techniczna (praca 2, pkt 6c). Wdrożenie tych osiągnięć nie byłoby jednak możliwe gdyby nie współpraca ze specjalistami z dziedziny medycyny oraz biologii, dzięki której możliwe było opracowanie narzędzi znajdujących praktyczne zastosowanie (prace 3 i 5, pkt 6c).
Objaśnienia:
* (pkt 2 i 6) – w czasie przygotowywania opisów należy mieć na uwadze stosowanie „słów kluczy”, odpowiednio dobranych fraz, które byłyby pomocne ekspertom w przyznaniu punktów. Np. jeżeli dany wpływ obejmuje nie tylko teren Polski, należy w opisie stosować określenie „zasięg międzynarodowy”; w przypadku wyjątkowo wielkiej wagi wpływu, należy w opisie stosować określenie „wpływ o przełomowym znaczeniu”.
** (pkt 3) – badania związane z powstaniem wpływu muszą zakończyć się nie wcześniej niż w dwudziestym roku przed okresem ewaluacji, zatem jest to okres 1997-2017. Badania te mogą również obejmować okres ewaluacji, czyli lata 2017-2021. Sam wpływ na społeczeństwo i/lub gospodarkę musi zostać ujawniony w okresie ewaluacji, czyli w latach 2017-2021. Należy podać, w którym roku z okresu ewaluacji został ujawniony ten wpływ społeczny. Np. badania trwały od roku 2005 do roku 2014 – czyli przed ewaluacją, a wpływ społeczny powstał w roku 2019 czyli w roku objętym ewaluacją.
*** (pkt 5a) – od liczby N uzależniona jest liczba opisów wpływu w danej dyscyplinie:
1) 2 opisy wpływu – jeżeli liczba N w tej dyscyplinie jest nie większa niż 100,00;
2) 3 opisy wpływu – jeżeli liczba N w tej dyscyplinie wynosi od 100,01 do 200,00;
3) 4 opisy wpływu – jeżeli liczba N w tej dyscyplinie wynosi od 200,01 do 300,00;
4) 5 opisów wpływu – jeżeli liczba N w tej dyscyplinie jest większa niż 300,00.
UWAGA: „nadmiarowe” opisy wpływu nie zaliczą się do ewaluacji, natomiast za każdy „brakujący” opis wpływu, niż wynika to z liczby N, przyznane będzie 0 pkt., co będzie miało negatywny wpływ na ostateczną punktację za kryterium nr 3 (poprzez obniżenie średniej arytmetycznej punktów za opisy).
**** (pkt 5a-5d) – ewaluowane podmioty zobligowane są do ustalenia kolejności opisów wpływu, co będzie równoznaczne z ustaleniem ich hierarchii.
***** (pkt 5d) – w zapisie „w związku z utworzeniem innego podmiotu w celu komercjalizacji wyników badań naukowych lub prac rozwojowych” chodzi o sytuację, w której PW utworzyła odrębny podmiot na potrzeby komercjalizacji badań. Podmiotem takim może być np. spółka spin-off. Natomiast nie może to być np. CZIiTT, który jest wewnętrzną jednostką ewaluowanego podmiotu, jakim jest Politechnika Warszawska.