Krauze Wojciech
Głównym obszarem moich zainteresowań jest obrazowanie ilościowe struktur biologicznych, które jest źródłem ważnych informacji na temat komórek i wycinków tkanek. Dwiema niezwykle interesującymi metodami z obszaru inżynierii fotonicznej, które realizują pomiary ilościowe są cyfrowa mikroskopia holograficzna (do pomiarów 2D) oraz optyczna tomografia dyfrakcyjna (do pomiarów 3D). Techniki te są nieniszczące i nie wymagają barwienia komórek biologicznych. Szczególną popularność w środowisku medycznym zyskała technika tomografii optycznej z ograniczonym zakresem kątowym projekcji. Ograniczony zakres kątowy pozwala na niezwykle proste i szybkie wykonanie pomiaru, skutkuje jednak zniekształconymi rekonstrukcjami tomograficznymi, dlatego kluczowe jest opracowanie specjalnych metod przetwarzania danych do tej metody. Opracowywanie takich algorytmów jest jednym z głównych zadań, które obecnie realizuję.
Poza samym opracowywaniem metod przetwarzania danych w tomografii i mikroskopii optycznej, dużo uwagi poświęcam zastosowaniom dwóch wyżej wymienionych metod w praktyce medycznej i biologicznej. Współpracuję z Warszawskim Uniwersytetem Medycznym oraz Instytutem Biologii Doświadczalnej PAN w zakresie wyznaczania parametrów hodowli komórkowych (komórki nerwowe, komórki nowotworowe, komórki skóry i wiele innych) oraz histologicznych wycinków tkanek.
Jestem współautorem 18 publikacji, w tym 7 z listy filadelfijskiej. Brałem udział w 4 konferencjach krajowych i 5 konferencjach międzynarodowych (USA, Niemcy, Holandia).
Uczestniczyłem w szkoleniach poświęconych zastosowaniu sieci neuronowych (szkoła letnia na Politechnice Gdańskiej), przetwarzaniu danych tomograficznych (miesięczny staż w Centrum Wiskunde & Informatica, Amsterdam, Holandia) a także komercjalizacji badań naukowych (szkolenie w ramach programu alfa.ac).
Jestem ekspertem programu Actphast 4.0, w ramach którego realizuję projekty wdrożeniowe z branży inżynierii fotonicznej dla europejskich firm z sektora małych i średnich przedsiębiorstw.
Uczestniczyłem w międzynarodowych targach innowacyjności na których przedstawiałem optyczny tomograf dyfrakcyjny opracowany w Zakładzie Inżynierii Fotonicznej PW, który został nagrodzony złotym medalem.
Jestem wykonawcą licznych projektów naukowych i wdrożeniowych:
- projektu Actphast realizowanego we współpracy z włoską firmą Italray,
- projektu Fundacji na Rzecz Nauki Polskiej TEAM, w którym opracowywane były techniki pozwalające na nieinwazyjne badanie fazowych mikroobiektów technicznych i biologicznych,
- projektu Fundacji na Rzecz Nauki Polskiej TEAM-TECH, w którym opracowywana jest handlowa wersja optycznego tomografu dyfrakcyjnego przeznaczonego do badań hodowli komórkowych, histologicznych wycinków tkanek i fazowych mikrostruktur inżynierskich,
- projektu Fundacji na Rzecz Nauki Polskiej IMPULS, w którym byłem odpowiedzialny za przygotowanie oprogramowania do obsługi cyfrowego mikroskopu holograficznego,
- projektu Narodowego Centrum Badań i Rozwoju NEUROPHASE, który realizowany jest we współpracy z Uniwersytetem w Tajwanie a który poświęcony jest badaniom wpływu substancji chińskiej medycyny ludowej na układ nerwowy człowieka.
Byłem kierownikiem dwuletniego projektu Preludium finansowanego przez Narodowe Centrum Nauki w ramach którego opracowywane było rozszerzenie optycznego tomografu dyfrakcyjnego pozwalające na badania z powiększoną głębią ostrości.
W 2017r. byłem jednym z laureatów nagrody zespołowej 1. stopnia JM Rektora PW za wybitne osiągnięcia naukowe.
W 2019r. zająłem 2. miejsce w konkursie Innowator Mazowsza organizowanego przez Urząd Marszałkowski.
Jestem członkiem komitetu organizacyjnego konferencji „Information Photonics” organizowanej w Jokohamie, Japonia, poświęconej nowoczesnym technologiom z zakresu inżynierii fotonicznej. Współpracuję z Uniwersytetem w Munster w zakresie obrazowania próbek biologicznych.
Obecnie ściśle współpracuję z włoską firmą Italray w ramach projektu Actphast 4.0 oraz Uniwersytetem NTNU (National Taiwan Normal University) w ramach projektu Neurophase finansowanego przez Narodowe Centrum Badań i Rozwoju.
Jestem zainteresowany współpracą ze studentami w zakresie metod obrazowania fazowych (przezroczystych) próbek technicznych i biologicznych. Techniki pomiarowe to przede wszystkich cyfrowa mikroskopia holograficzna i optyczna tomografia dyfrakcyjna.
Potencjalne tytuły prac dyplomowych związane mogą być z:
- algorytmami przetwarzania obrazów (np. segmentacji komórek biologicznych w rekonstrukcjach tomograficznych),
- algorytmami rekonstrukcji tomograficznej,
- algorytmami odzyskiwania fazy z pomiarów interferometrycznych,
- analizą statystyczną wyników mikroskopowych i tomograficznych,
- metodyką wyznaczania parametrów komórek biologicznych na podstawie ich pomiarów cyfrową mikroskopią holograficzną lub optyczną tomografią dyfrakcyjną,
- analizą zmian parametrów wybranych hodowli komórkowych w czasie pod wpływem czynników zewnętrznych (substancji chemicznych, temperatury, wilgotności, składu chemicznego powietrza itp.).
W trakcie:
- Increasing signal to noise ratio in a tomographic reconstruction through averaging of reconstructions obtained from subsets of projections (praca inżynierska),
- Statistical analysis of selected parameters of biological cells investigated with digital holographic microscopy (praca inżynierska)
Interesuje się literaturą, filmami i serialami z gatunku fantasy i science-fiction. Lubię słuchać muzyki filmowej. W lato jeżdżę na rowerze a w zimie na nartach biegowych.
